Přihlašování probíhá pomocí stejných údajů jako při klasickém přihlášení do webového rozhraní. Při prvním přihlášení do aplikace vyplníme pole "Uživatelské jméno" a "Heslo".
Dále zvolíme aktivní server, na nějž se přihlašujeme. Zde platí, že uživatelé ze základních škol, zřizovaných Městem Plzeň, se přihlašují na server skola.plzen-edu.cz, ostatní uživatelé volí server aplikace.skolaonline.cz.
Pokud si chceme pro následující přístupy do aplikace vytvořit tzv. přihlašovací profil, nastavíme posuvník u pole "Zapamatovat pro příště" jako aktivní, tedy doprava. Díky tomu nebude nutné zadávat při kterémkoliv dalším vstupu do aplikace znovu přihlašovací údaje. V jednom mobilním zařízení lze uložit libovolný počet přihlašovacích profilů, což ocení všichni, jimž náleží několik uživatelských účtů (např. rodiče s více účty).
Nakonec se přihlásíme do účtu tlačítkem "Přihlásit se".