Menu slouží k psaní nových zpráv a obsahuje výpisové formuláře odeslaných a přijatých zpráv. Zprávy si mohou posílat učitelé navzájem, mohou být odesílány žákům/studentům a jejich zákonným zástupcům.
Při požadavku na odeslání zprávy je nejprve nutné zvolit příjemce zprávy, poté zadat Předmět zprávy (výstižný popisek zprávy zobrazený příjemci) a vlastní text zprávy. Funkčnost modulu Komunikace rovněž umožňuje odeslání zprávy prostřednictvím e-mailu. Aplikace Škola OnLine také umožňuje přijímat elektronické omluvenky, které jsou dostupné všem uživatelům (zákonným zástupcům), ale záleží na každé škole, jestli bude tyto druhy omluvenek akceptovat, či nikoliv.
Součástí odesílané zprávy může být také příloha za předpokladu, že je odesílaná na e-mail.
Aplikace umožňuje v rámci modulu Komunikace odeslání zprávy s hlasováním.